「吉原彼岸花 久遠の契り」のゲームシステムは、オーソドックスなアドベンチャーゲームです。
物語の随所に出てくる選択肢によりその後の展開が変化していき、様々なエンディングをお楽しみいただけます。
用語辞典を搭載しており、江戸時代や遊郭ならではの言葉を詳しく知らないかたも安心してお楽しみいただけます。
用語辞典はタイトルメニューおよびシステムメニューからいつでも確認できるほか、用語辞典に登録されている言葉が物語中に出てくると文字の色が変わる機能も搭載。物語中で文字の色が変わる機能は、環境設定で「オフ」にすることも可能です。
定評のある早送り＆早戻し機能はもちろんのこと、より快適にお楽しみいただけるよう、多彩な機能を搭載しています。
・選択肢の表示位置変更機能（中央 or 下）
・既読の選択肢へのジャンプ機能
・ロード地点からの巻き戻しも可能
・バックログで選択したメッセージからの再開機能
・クイックセーブ＆クイックロード機能
・キャラクター別のボイス音量調節機能
「CG鑑賞」「音楽鑑賞」「シーン回想」「エンディングリスト」のほかにも、「ボイスコレクション機能」などを搭載しています。
・ボイスコレクション機能
ゲーム中のお気に入りのボイスを登録して、何度でも繰り返し聴くことのできるボイスコレクション機能を搭載。
また、ボイスコレクションに登録したボイスをお好みの順番で再生できるプレイリスト機能もあり、ゲーム中のBGMを設定することもできるので、自分だけのボイスドラマを作ってお楽しみいただくことも可能です。